Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR4Q05215 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR4Q05215 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms