Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RELAQ04206 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RELAQ04206 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELAQ04206 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELAQ04206 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELAQ04206 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELAQ04206 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELAQ04206 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELAQ04206 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RELAQ04206 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RELAQ04206 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RELAQ04206 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RELAQ04206 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms