Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRF8Q02556 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms