Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP4Q02446 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SP4Q02446 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP4Q02446 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP4Q02446 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP4Q02446 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SP4Q02446 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP4Q02446 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP4Q02446 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP4Q02446 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP4Q02446 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP4Q02446 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP4Q02446 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP4Q02446 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP4Q02446 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP4Q02446 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP4Q02446 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SP4Q02446 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP4Q02446 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP4Q02446 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP4Q02446 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP4Q02446 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms