Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPEQ02224 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPEQ02224 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms