Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms