Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms