Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1BQ00975 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1BQ00975 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms