Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF1Q00613 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms