Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD3P84022 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD3P84022 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms