Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIM1P81133 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIM1P81133 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIM1P81133 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIM1P81133 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SIM1P81133 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIM1P81133 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIM1P81133 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIM1P81133 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIM1P81133 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIM1P81133 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIM1P81133 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIM1P81133 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIM1P81133 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIM1P81133 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIM1P81133 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIM1P81133 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms