Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ELF3P78545 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELF3P78545 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELF3P78545 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELF3P78545 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELF3P78545 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELF3P78545 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELF3P78545 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELF3P78545 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELF3P78545 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELF3P78545 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELF3P78545 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms