Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IP78347 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms