Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBX1P62877 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBX1P62877 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RBX1P62877 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBX1P62877 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBX1P62877 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBX1P62877 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBX1P62877 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBX1P62877 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBX1P62877 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBX1P62877 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms