Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VBP1P61758 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VBP1P61758 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VBP1P61758 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VBP1P61758 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VBP1P61758 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VBP1P61758 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VBP1P61758 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VBP1P61758 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms