Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA6P60900 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA6P60900 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms