Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms