Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms