Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX16P57768 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX16P57768 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX16P57768 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX16P57768 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX16P57768 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX16P57768 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX16P57768 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX16P57768 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX16P57768 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX16P57768 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX16P57768 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX16P57768 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX16P57768 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX16P57768 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX16P57768 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms