Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGF8P55075 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGF8P55075 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGF8P55075 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGF8P55075 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGF8P55075 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGF8P55075 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGF8P55075 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGF8P55075 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGF8P55075 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGF8P55075 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGF8P55075 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms