Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLTPP55058 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLTPP55058 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLTPP55058 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLTPP55058 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLTPP55058 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLTPP55058 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLTPP55058 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLTPP55058 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PLTPP55058 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLTPP55058 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLTPP55058 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLTPP55058 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLTPP55058 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLTPP55058 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLTPP55058 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLTPP55058 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLTPP55058 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms