Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms