Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZA1P52907 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZA1P52907 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZA1P52907 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZA1P52907 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZA1P52907 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZA1P52907 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZA1P52907 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZA1P52907 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZA1P52907 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZA1P52907 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZA1P52907 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms