Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST1P52848 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST1P52848 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDST1P52848 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDST1P52848 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDST1P52848 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDST1P52848 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDST1P52848 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDST1P52848 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST1P52848 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST1P52848 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST1P52848 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST1P52848 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST1P52848 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST1P52848 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST1P52848 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST1P52848 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST1P52848 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST1P52848 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST1P52848 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms