Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK4P51957 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK4P51957 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK4P51957 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK4P51957 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK4P51957 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK4P51957 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK4P51957 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK4P51957 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK4P51957 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK4P51957 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK4P51957 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK4P51957 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK4P51957 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK4P51957 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK4P51957 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK4P51957 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK4P51957 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK4P51957 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms