Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP5P51878 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP5P51878 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP5P51878 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP5P51878 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP5P51878 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP5P51878 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP5P51878 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP5P51878 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP5P51878 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP5P51878 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP5P51878 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP5P51878 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP5P51878 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP5P51878 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP5P51878 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP5P51878 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP5P51878 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP5P51878 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP5P51878 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP5P51878 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP5P51878 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms