Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1GP51170 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms