Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAMP50895 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAMP50895 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAMP50895 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAMP50895 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAMP50895 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAMP50895 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAMP50895 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAMP50895 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAMP50895 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAMP50895 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAMP50895 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAMP50895 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAMP50895 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAMP50895 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAMP50895 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
BCAMP50895 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAMP50895 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAMP50895 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAMP50895 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAMP50895 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAMP50895 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAMP50895 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAMP50895 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAMP50895 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAMP50895 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAMP50895 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAMP50895 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAMP50895 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAMP50895 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAMP50895 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAMP50895 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAMP50895 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAMP50895 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAMP50895 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAMP50895 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAMP50895 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAMP50895 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAMP50895 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAMP50895 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAMP50895 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAMP50895 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAMP50895 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAMP50895 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAMP50895 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAMP50895 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms