Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATMP50440 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATMP50440 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATMP50440 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATMP50440 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATMP50440 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATMP50440 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATMP50440 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATMP50440 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATMP50440 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GATMP50440 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATMP50440 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GATMP50440 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GATMP50440 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATMP50440 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATMP50440 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATMP50440 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATMP50440 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GATMP50440 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATMP50440 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATMP50440 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATMP50440 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATMP50440 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATMP50440 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATMP50440 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATMP50440 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATMP50440 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATMP50440 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms