Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLK1P49759 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLK1P49759 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLK1P49759 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLK1P49759 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLK1P49759 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLK1P49759 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLK1P49759 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CLK1P49759 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLK1P49759 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLK1P49759 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLK1P49759 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLK1P49759 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLK1P49759 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLK1P49759 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLK1P49759 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLK1P49759 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLK1P49759 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLK1P49759 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLK1P49759 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms