Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPFP49454 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPFP49454 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPFP49454 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPFP49454 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPFP49454 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPFP49454 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPFP49454 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPFP49454 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPFP49454 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPFP49454 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPFP49454 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPFP49454 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPFP49454 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPFP49454 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPFP49454 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPFP49454 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPFP49454 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPFP49454 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPFP49454 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPFP49454 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPFP49454 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPFP49454 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPFP49454 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms