Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNI2P48788 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms