Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A3P48751 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A3P48751 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms