Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITPNBP48739 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms