Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AMTP48728 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMTP48728 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMTP48728 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMTP48728 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms