Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A9P48067 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A9P48067 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms