Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC1P41238 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms