Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARL1P40616 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARL1P40616 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARL1P40616 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARL1P40616 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ARL1P40616 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ARL1P40616 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ARL1P40616 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ARL1P40616 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL1P40616 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL1P40616 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL1P40616 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL1P40616 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL1P40616 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL1P40616 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL1P40616 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL1P40616 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL1P40616 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL1P40616 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL1P40616 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL1P40616 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL1P40616 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms