Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THPOP40225 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THPOP40225 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THPOP40225 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
THPOP40225 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THPOP40225 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THPOP40225 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THPOP40225 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
THPOP40225 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THPOP40225 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
THPOP40225 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THPOP40225 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THPOP40225 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THPOP40225 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THPOP40225 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THPOP40225 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THPOP40225 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
THPOP40225 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THPOP40225 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THPOP40225 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THPOP40225 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THPOP40225 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THPOP40225 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THPOP40225 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THPOP40225 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THPOP40225 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THPOP40225 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THPOP40225 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THPOP40225 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THPOP40225 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THPOP40225 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THPOP40225 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms