Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms