Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCA1P38398 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA1P38398 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA1P38398 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA1P38398 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA1P38398 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA1P38398 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA1P38398 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA1P38398 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA1P38398 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA1P38398 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRCA1P38398 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms