Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP6P35125 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP6P35125 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP6P35125 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP6P35125 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP6P35125 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP6P35125 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP6P35125 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP6P35125 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP6P35125 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP6P35125 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP6P35125 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP6P35125 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP6P35125 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP6P35125 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP6P35125 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP6P35125 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP6P35125 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP6P35125 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP6P35125 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP6P35125 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP6P35125 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP6P35125 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP6P35125 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP6P35125 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP6P35125 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP6P35125 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP6P35125 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP6P35125 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP6P35125 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP6P35125 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP6P35125 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms