Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CHRNA5P30532 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA5P30532 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms