Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC27P30260 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC27P30260 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC27P30260 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC27P30260 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC27P30260 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC27P30260 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC27P30260 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC27P30260 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC27P30260 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC27P30260 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC27P30260 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC27P30260 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC27P30260 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC27P30260 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC27P30260 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC27P30260 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC27P30260 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC27P30260 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC27P30260 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC27P30260 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC27P30260 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC27P30260 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC27P30260 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC27P30260 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC27P30260 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC27P30260 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC27P30260 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC27P30260 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC27P30260 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC27P30260 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC27P30260 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC27P30260 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC27P30260 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC27P30260 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC27P30260 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC27P30260 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC27P30260 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC27P30260 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC27P30260 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC27P30260 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC27P30260 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC27P30260 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC27P30260 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC27P30260 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC27P30260 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC27P30260 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms