Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECHS1P30084 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECHS1P30084 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms