Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD1P29536 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms