Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP1P29466 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP1P29466 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP1P29466 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP1P29466 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP1P29466 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP1P29466 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP1P29466 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP1P29466 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP1P29466 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP1P29466 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP1P29466 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP1P29466 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP1P29466 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP1P29466 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP1P29466 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP1P29466 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP1P29466 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP1P29466 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP1P29466 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP1P29466 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP1P29466 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP1P29466 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP1P29466 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP1P29466 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP1P29466 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP1P29466 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP1P29466 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP1P29466 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms