Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMA1P25786 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA1P25786 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms