Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3P25205 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3P25205 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3P25205 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3P25205 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3P25205 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3P25205 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3P25205 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3P25205 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3P25205 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM3P25205 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3P25205 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3P25205 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3P25205 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3P25205 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3P25205 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3P25205 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM3P25205 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM3P25205 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM3P25205 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM3P25205 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM3P25205 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms