Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNCP24863 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNCP24863 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNCP24863 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNCP24863 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNCP24863 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNCP24863 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNCP24863 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNCP24863 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNCP24863 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNCP24863 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNCP24863 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNCP24863 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNCP24863 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNCP24863 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNCP24863 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNCP24863 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNCP24863 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNCP24863 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNCP24863 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNCP24863 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNCP24863 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNCP24863 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNCP24863 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNCP24863 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNCP24863 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNCP24863 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNCP24863 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNCP24863 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNCP24863 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNCP24863 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNCP24863 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNCP24863 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNCP24863 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNCP24863 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNCP24863 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
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